Եթովպիայում SARS-CoV-2-ի հայտնաբերման չորս նուկլեինաթթվի ուժեղացման փորձարկումների կատարումը

Շնորհակալություն Nature.com այցելելու համար: Դուք օգտագործում եք զննարկչի տարբերակ՝ CSS-ի սահմանափակ աջակցությամբ: Լավագույն փորձի համար խորհուրդ ենք տալիս օգտագործել թարմացված դիտարկիչ (կամ անջատել Համատեղելիության ռեժիմը Internet Explorer-ում): Բացի այդ, շարունակական աջակցություն ապահովելու համար մենք կայքը ցուցադրում ենք առանց ոճերի և JavaScript-ի:
Ցուցադրում է միանգամից երեք սլայդներից բաղկացած կարուսել: Օգտագործեք «Նախորդ» և «Հաջորդ» կոճակները՝ միաժամանակ երեք սլայդներով շարժվելու համար, կամ օգտագործեք վերջում գտնվող սլայդերի կոճակները՝ միաժամանակ երեք սլայդների միջով անցնելու համար:
2019 թվականի կորոնավիրուսային հիվանդության (COVID-19) բռնկումից ի վեր ամբողջ աշխարհում մշակվել են նուկլեինաթթվի ուժեղացման բազմաթիվ առևտրային թեստեր (NAATs) և դարձել ստանդարտ վերլուծություններ: Չնայած մի քանի թեստեր արագ մշակվեցին և կիրառվեցին լաբորատոր ախտորոշիչ թեստերի համար, այդ թեստերի կատարումը չի գնահատվել տարբեր պարամետրերում: Հետևաբար, այս ուսումնասիրությունը նպատակ ուներ գնահատել Abbott SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI և Sansure Biotech վերլուծությունների կատարումը՝ օգտագործելով Composite Reference Standard (CRS): Հետազոտությունն անցկացվել է Եթովպիայի հանրային առողջության ինստիտուտում (EPHI) 2020 թվականի դեկտեմբերի 1-ից 30-ը: Քթի-կոկորդի 164 նմուշ է արդյունահանվել՝ օգտագործելով QIAamp RNA մինի հավաքածուն և Abbott ԴՆԹ-ի նմուշների պատրաստման համակարգը: 164 նմուշներից 59,1%-ը դրական է, իսկ 40,9%-ը՝ բացասական: Sansure Biotech-ի դրականությունը զգալիորեն ցածր էր CRS-ի համեմատ (p <0.05): Sansure Biotech-ի դրականությունը զգալիորեն ցածր էր CRS-ի համեմատ (p <0.05): Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению со CRS (p < 0,05): Sansure Biotech-ի դրական արդյունքները զգալիորեն ցածր էին CRS-ի համեմատ (p <0.05):与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）։与CRS 相比，Sansure Biotech 的阳性率显着较低（p <0.05）։ У Sansure Biotech было значительно понише положительных результатов по сравнению со CRS (p < 0,05): Sansure Biotech-ը զգալիորեն ավելի քիչ դրական արդյունքներ է ունեցել CRS-ի համեմատ (p <0.05):Չորս վերլուծությունների ընդհանուր համաձայնությունը 96,3–100% էր՝ համեմատած CRS-ի հետ: Ի լրումն Sansure Biotech վերլուծության ցածր դրական մակարդակի, չորս վերլուծությունների կատարումը գրեթե համադրելի էր: Որպես այդպիսին, Sansure Biotech [Միայն հետազոտական ​​(RUO)] վերլուծությունը պահանջում է լրացուցիչ վավերացում Եթովպիայում դրա օգտագործման համար: Ի վերջո, պետք է դիտարկել լրացուցիչ հետազոտություններ՝ համապատասխան արտադրողի պնդումներով վերլուծությունները գնահատելու համար:
Լաբորատոր փորձարկումը Առողջապահության համաշխարհային կազմակերպության (ԱՀԿ) Կորոնավիրուսային հիվանդության 2019 (COVID-19) պատրաստվածության և արձագանքման (SPRP) ռազմավարական ծրագրի մի մասն է։ ԱՀԿ-ն խորհուրդ է տալիս երկրներին զարգացնել լաբորատոր կարողություններ՝ բարելավելու պատրաստվածությունը, դեպքերի պատշաճ կառավարումը, զգոնությունը և հանրային առողջապահության մարտահրավերներին արագ արձագանքելը: Սա խոսում է այն մասին, որ լաբորատորիայի դերը առանցքային է զարգացող վարակիչ հարուցիչների հիվանդության և համաճարակաբանության բնութագրման և դրանց տարածումը վերահսկելու համար:
COVID-19-ի ախտորոշումը պահանջում է համաճարակաբանական և բժշկական տեղեկատվություն, անձնական ախտանիշներ/նշաններ և ռադիոգրաֆիկ և լաբորատոր տվյալներ2։ Քանի որ COVID-19-ի բռնկումը գրանցվել է Չինաստանի Ուհան քաղաքում, ամբողջ աշխարհում մշակվել են բազմաթիվ առևտրային նուկլեինաթթվի ուժեղացման թեստեր (NAATs): Իրական ժամանակում հակադարձ տրանսկրիպցիոն պոլիմերազային շղթայական ռեակցիան (rRT-PCR) օգտագործվել է որպես սովորական և ստանդարտ մեթոդ՝ սուր շնչառական 2-ի (SARS-CoV-2)3 վարակի ծանր սուր շնչառական համախտանիշի լաբորատոր ախտորոշման համար: SARS-CoV-2-ի մոլեկուլային հայտնաբերումը սովորաբար հիմնված է N (նուկլեոկապսիդային սպիտակուցի գեն), E (ծրարային սպիտակուցի գեն) և RdRp (ՌՆԹ-ից կախված ՌՆԹ պոլիմերազի գեն) գեների վրա ORF1a/b (բաց ընթերցման շրջանակ 1a/b) . գեն) վիրուսի գենոմից հայտնաբերված տարածաշրջան: Դրանք համարվում են վիրուսային գենոմներում հայտնաբերված հիմնական պահպանված շրջանները՝ վիրուսների ճանաչման համար4: Այս գեներից RdRp և E գեներն ունեն բարձր անալիտիկ հայտնաբերման զգայունություն, մինչդեռ N գենը՝ ցածր անալիտիկ զգայունություն5:
PCR վերլուծությունների կատարումը կարող է տարբեր լինել՝ կախված տարբեր գործոններից, ինչպիսիք են՝ արդյունահանման ռեակտիվները, ուժեղացման/հայտնաբերման ռեակտիվները, արդյունահանման մեթոդը, PCR մեքենայի որակը և այլ գործիքներ: 2020 թվականի ապրիլի դրությամբ ավելի քան 48 տարբեր ախտորոշիչ սարքեր ինը երկրներից ստացել են Արտակարգ իրավիճակների օգտագործման թույլտվություն (EUA)՝ COVID-196 ախտորոշման համար։ Եթովպիայում իրական ժամանակում ավելի քան 14 PCR հարթակներ օգտագործվում են SARS-CoV-2-ի PCR հայտնաբերման համար 26 հանրային առողջապահական հաստատություններում, ներառյալ ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 և Quant-studio7: Բացի այդ, հասանելի են տարբեր PCR թեստային փաթեթներ, ինչպիսիք են Daan Gene թեստը, Abbott SARS-CoV-2 թեստը, Sansure Biotech թեստը և SARS-CoV-2 BGI թեստը: Չնայած rRT-PCR-ն խիստ զգայուն է, COVID-19-ով որոշ հիվանդներ հաղորդում են կեղծ բացասական արդյունքներ՝ կապված նմուշներում վիրուսային ռիբոնուկլեինաթթվի (ՌՆԹ) անբավարար պատճենների հետ՝ սխալ հավաքման, տեղափոխման, պահպանման և մշակման և լաբորատոր փորձարկման պատճառով: անձնակազմի պայմաններն ու գործողությունները8. Բացի այդ, նմուշի կամ հսկողության սխալ օգտագործումը, ցիկլի շեմի (Ct) կարգավորումը և այլ պաթոգեն նուկլեինաթթուների կամ ոչ ակտիվ/մնացորդային SARS-CoV-2 ՌՆԹ-ի հետ փոխազդեցությունը կարող են հանգեցնել rRT-PCR9 վերլուծությունների կեղծ դրական արդյունքների: Այսպիսով, պարզ է, որ PCR թեստերն իսկապես կարող են բացահայտել գենի բեկորների կրողներին, քանի որ նրանք չեն կարող նույնիսկ տարբերակել իսկապես ակտիվ վիրուսային գեները, ուստի թեստերը կարող են բացահայտել միայն կրողներին, այլ ոչ հիվանդներին10: Հետևաբար, կարևոր է գնահատել ախտորոշման արդյունավետությունը՝ օգտագործելով ստանդարտ մեթոդները մեր միջավայրում: Թեև շատ NAAT ռեակտիվներ հասանելի են Եթովպիայի հանրային առողջության ինստիտուտում (EPHI) և ամբողջ երկրում, դրանց արդյունավետության համեմատական ​​գնահատական ​​դեռ չի հաղորդվել: Հետևաբար, այս ուսումնասիրությունը նպատակ ուներ գնահատել առևտրային հասանելի փաթեթների համեմատական ​​արդյունավետությունը rRT-PCR-ով SARS-CoV-2-ի հայտնաբերման համար՝ օգտագործելով կլինիկական նմուշներ:
Ընդհանուր առմամբ 164 մասնակից՝ COVID-19-ի կասկածանքով, ընդգրկվել է այս հետազոտության մեջ։ Նմուշների մեծ մասը եղել են բուժման կենտրոններից (118/164 = 72%), իսկ մնացած 46 (28%) մասնակիցները եղել են ոչ բուժական կենտրոններից: Կենտրոնում չբուժված մասնակիցներից 15-ի (9,1%) կլինիկական կասկածելի դեպքեր և 31-ի (18,9%) հաստատված դեպքերի կոնտակտ է եղել: Իննսուներեք (56.7%) մասնակիցներ արական սեռի էին, իսկ մասնակիցների միջին (± SD) տարիքը 31.10 (± 11.82) տարի էր:
Այս ուսումնասիրության ընթացքում որոշվել են COVID-19-ի չորս թեստերի դրական և բացասական ցուցանիշները: Այսպիսով, Abbott SARS-CoV-2 հետազոտության, Daan Gene 2019-nCoV հետազոտության, SARS-CoV-2 BGI հետազոտության և Sansure Biotech 2019-nCoV հետազոտության դրական դրույքաչափերը համապատասխանաբար կազմել են 59,1%, 58,5%, 57,9% և 55: . Դրական և բացասական կոմպոզիտային ստանդարտ ստանդարտների (CRS) միավորները համապատասխանաբար կազմել են 97 (59.1%) և 67 (40.9%) (Աղյուսակ 1): Այս ուսումնասիրության մեջ CRS-ի սահմանումը հիմնված էր «ցանկացած դրական» կանոնի վրա, որի համաձայն չորս թեստի արդյունքներից երկու կամ ավելի թեստի արդյունքներ, որոնք տվել են նույն արդյունքը, համարվում էին իրական դրական կամ բացասական:
Այս ուսումնասիրության մեջ մենք գտանք բացասական տոկոսային համաձայնություն (NPA) 100% (95% CI 94.6–100) բոլոր վերլուծությունների համար՝ համեմատած CRS-ի հետ: Sansure Biotechnology-ի վերլուծությունը ցույց տվեց նվազագույն PPA 93.8% (95% CI 87.2-97.1), իսկ Daan Gene 2019-nCoV վերլուծությունն ուներ ընդհանուր համաձայնություն 99.4% (95% CI 96.6-99.9): Ի հակադրություն, SARS-CoV-2 BGI հետազոտության և Sansure Biotech 2019-nCoV հետազոտության միջև ընդհանուր համաձայնությունը կազմել է համապատասխանաբար 98,8% և 96,3% (Աղյուսակ 2):
CRS-ի և Abbott SARS-CoV-2 վերլուծության արդյունքների միջև Քոհենի կապա գործակիցը լիովին համահունչ էր (K = 1.00): Նմանապես, Daan Gene 2019-nCoV-ի, SARS-CoV-2 BGI-ի և Sansure Biotech 2019-nCoV-ի կողմից հայտնաբերված Քոհենի կապպա արժեքները նույնպես լիովին համապատասխանում են CRS-ին (K ≥ 0,925): Այս համեմատական ​​վերլուծության մեջ chi-square թեստը (McNemar թեստ) ցույց տվեց, որ Sansure Biotech 2019-nCoV փորձարկման արդյունքները զգալիորեն տարբերվում էին CRS-ի արդյունքներից (p = 0,031) (Աղյուսակ 2):
Ինչպես ցույց է տրված Նկ.1 Abbott SARS-CoV-2 հետազոտության ամենացածր Ct արժեքի (<20 Ct) տոկոսը (համակցված RdRp և N գեն) եղել է 87,6%, իսկ ORF1a/b գենի Ct արժեքը Sansure Biotech 2019-nCoV հետազոտության մեջ ցույց է տվել, որ ցածր տոկոսը Ct արժեքը (< 20 Ct) կազմել է 50.3%, իսկ բարձր Ct արժեքը (36–40 Ct) կազմել է 3,2%: 1 Abbott SARS-CoV-2 հետազոտության ամենացածր Ct արժեքի (<20 Ct) տոկոսը (համակցված RdRp և N գեն) եղել է 87,6%, իսկ ORF1a/b գենի Ct արժեքը Sansure Biotech 2019-nCoV հետազոտության մեջ ցույց է տվել, որ ցածր տոկոսը Ct արժեքը (< 20 Ct) կազմել է 50.3%, իսկ բարձր Ct արժեքը (36–40 Ct) կազմել է 3,2%:Ինչպես ցույց է տրված Նկ.1, процент наименьшего значения Ct (< 20 Ct) վերլուծություն Abbott SARS-CoV-2 (համակցված գեն RdRp и N) կազմում է 87,6%, ինչը նշանակում է Ct գենա ORF1a/b վերլուծություն Sansure Biotech 2019-nCoV (< 20 Ct) կազմված է 50,3%, а высокое значение Ct (36–40 Ct) կազմված է 3,2%։ 1, Abbott SARS-CoV-2-ի (համակցված գենի RdRp և N) ամենացածր Ct արժեքի (<20 Ct) վերլուծության տոկոսը կազմել է 87,6%, իսկ Sansure Biotech 2019-nCoV-ի ORF1a/b գենի վերլուծության Ct արժեքը ցույց է տվել: որ ցածր Ct արժեքի տոկոսը (< 20 Ct) կազմել է 50,3%, իսկ բարձր արժեք Ct (36–40 Ct) կազմել է 3,2%։如图1 所示，Abbott SARS-CoV-2 检测（结合RdRp 和N 基因）的最低Ct 值百分比（<20%otech. 2019-nCoV 检测的ORF1a/b 基因Ct 值显示低Ct 值(< 20 Ct) 的百分比为50.3%，高Ct 值Ct6 (< 20 Ct)的百分比为3.2%։ Ինչպես ցույց է տրված Նկար 1-ում, Abbott SARS-CoV-2 թեստի ամենացածր Ct արժեքի տոկոսը (<20 Ct) (RdRp և N գենի համակցություն) կազմում է 87,6%, Sansure Biotech 2019-nCoV թեստի ORF1a/b գենի Ct արժեքը։ ցույց է տալիս ցածր Ct值(< 20 Ct) 的 տոկոսը կազմում է 50,3%,高Ct 值(36–40 Ct) 的 տոկոսը կազմում է 3,2%։ Ինչպես ցուցադրել է рисунке 1-ը, վերլուծել Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) նշել միայն ցածր տոկոսային նշանակություն Ct (< 20 Ct) տարբեր 87,6%, а значение Ct гена ORF1a/b technoe исуле. - Անալիզ nCoV показал низкий Ct. Ինչպես ցույց է տրված Նկար 1-ում, Abbott SARS-CoV-2 վերլուծությունը (համատեղելով RdRp և N գեները) ուներ ամենացածր տոկոսային Ct արժեքը (< 20 Ct)՝ 87,6%, մինչդեռ ORF1a/b գենի Ct արժեքը Sansure-ում: Biotech 2019 ուսումնասիրություն – nCoV-ի վերլուծությունը ցույց է տվել ցածր Ct: Процент значений (< 20 Ct) կազմում է 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) կազմում է 3,2%։ Արժեքների տոկոսը (< 20 Ct) կազմել է 50,3%, իսկ բարձր Ct արժեքների տոկոսը (36–40 Ct) կազմել է 3,2%:Abbott SARS-CoV-2 B թեստը գրանցել է Ct-ի արժեքները 30-ից բարձր: Մյուս կողմից, BGI SARS-CoV-2 հետազոտության ժամանակ ORF1a/b գենն ուներ Ct բարձր արժեք (> 36 Ct) տոկոսը կազմում էր 4% (նկ. 1): Մյուս կողմից, BGI SARS-CoV-2 հետազոտության ժամանակ ORF1a/b գենն ուներ Ct բարձր արժեք (> 36 Ct) տոկոսը կազմում էր 4% (նկ. 1): С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 գեն ORF1a/b անվանել մեծ նշանակություն Ct (> 36 Ct), տոկոսադրույքը կազմված է 4% (рис. 1): Մյուս կողմից, BGI SARS-CoV-2 գենի վերլուծության ժամանակ ORF1a/b-ն ուներ Ct բարձր արժեք (> 36 Ct), որի տոկոսը կազմում էր 4% (նկ. 1):另一方面，在BGI SARS-CoV-2 检测中，ORF1a/b 基因具有高Ct 值（> 36 Ct）的百分比中 Մյուս կողմից, BGI SARS-CoV-2 հայտնաբերման դեպքում բարձր Ct արժեքով ORF1a/b գենի տոկոսը (>36 Ct) կազմում է 4% (Նկար 1): С другой стороны, в анализа BGI SARS-CoV-2 տոկոսը գենով ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) կազմում է 4% (рис. 1): Մյուս կողմից, BGI SARS-CoV-2 վերլուծության մեջ Ct բարձր արժեքներով ORF1a/b գեների տոկոսը (>36 Ct) կազմել է 4% (նկ. 1):
Այս հետազոտության ընթացքում մենք վերցրել ենք 164 քիթ-կոկորդի նմուշ: Բոլոր տեսակի անալիզների համար ՌՆԹ-ի մեկուսացումը և ուժեղացումը կատարվել են համապատասխան արտադրողների կողմից առաջարկված մեթոդների և փաթեթների միջոցով:
Այս ուսումնասիրությունը ցույց տվեց, որ SARS-CoV-2-ի համար Abbott-ի թեստն ունի նույն հայտնաբերման արդյունավետությունը, ինչ CRS-ը՝ 100% դրական, բացասական և ընդհանուր համապատասխանությամբ: Քոհենի կապպա պայմանագիրը 1.00 է, ինչը ցույց է տալիս CRS-ի հետ լիարժեք համաձայնությունը: ԱՄՆ-ում Վաշինգտոնի համալսարանի նմանատիպ ուսումնասիրությունը ցույց է տվել, որ SARS-CoV-2-ի համար Abbott թեստի ընդհանուր զգայունությունն ու առանձնահատկությունը համապատասխանաբար կազմում է 93% և 100%՝ համեմատած CDC-ի լաբորատոր որոշված ​​հետազոտության (LDA) հետ։ . 11. Abbott SARS-CoV-2-ի հայտնաբերման համակարգը հիմնված է N և RdRp գեների միաժամանակյա համակցված հայտնաբերման վրա, քանի որ երկու գեներն էլ ավելի զգայուն են՝ նվազագույնի հասցնելով կեղծ բացասականները12: Վիեննայում (Ավստրիա) կատարված ուսումնասիրությունը նաև ցույց է տվել, որ արդյունահանման նմուշների մեծ ծավալները և հայտնաբերման լուծիչի ծավալները նվազագույնի են հասցնում նոսրացման ազդեցությունը և բարձրացնում հայտնաբերման արդյունավետությունը13: Այսպիսով, Abbott-ի կատարյալ համընկնումն SARS-CoV-2 վերլուծության համար կարող է կապված լինել հարթակի հայտնաբերման համակարգի հետ, որը միաժամանակ հայտնաբերում է կոմբինատոր գեները, հանում է մեծ քանակությամբ նմուշներ (0,5 մլ) և օգտագործում մեծ քանակությամբ էլուենտ (40 մկլ):
Մեր արդյունքները նաև ցույց տվեցին, որ Դաանի գենետիկ թեստի հայտնաբերման արդյունավետությունը գրեթե նույնն էր, ինչ CRS-ին: Սա համահունչ է Չինաստանի Հուայնանի Անհուի համալսարանում անցկացված ուսումնասիրությանը14 և արտադրողի 100% դրական համաձայնության մասին պնդումներին: Չնայած հետևողական արդյունքների մասին հաղորդագրություններին, մեկ նմուշը կեղծ բացասական է եղել նույն լուծույթը վերստուգելուց հետո, սակայն դրական է եղել Abbott SARS-CoV-2 և Sansure Biotech nCoV-2019 փորձարկումներում: Սա ենթադրում է, որ տարբեր տեսակի վերլուծությունների ընթացքում կարող են լինել արդյունքների փոփոխականություն: Այնուամենայնիվ, Չինաստանում15 իրականացված ուսումնասիրության մեջ Daan Gene-ի վերլուծության արդյունքը զգալիորեն տարբերվում էր (p <0,05)՝ համեմատած նրանց լաբորատոր տեղեկանքի որոշման հետ: Այնուամենայնիվ, Չինաստանում15 իրականացված ուսումնասիրության մեջ Daan Gene-ի վերլուծության արդյունքը զգալիորեն տարբերվում էր (p <0,05)՝ համեմատած նրանց լաբորատոր տեղեկանքի որոշման հետ: Тем не мие, в исследовании, проведенном в Китае15, результат վերլուծություն Daan Gene նշանակալի отличался (p < 0,05) от их лабораторного эталонного վերլուծություն: Այնուամենայնիվ, Չինաստանում15 ուսումնասիրության ժամանակ Դաան Գենի վերլուծության արդյունքը զգալիորեն տարբերվում էր (p <0,05) նրանց լաբորատոր տեղեկատու վերլուծությունից:然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异（p < 0,05):然而，在中国进行的研究中15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差<0,05 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты գենետիկական թեստային Daan значительно отличались (p < 0,05) по сравнению с его эталонным лабораторным тестом. Այնուամենայնիվ, Չինաստանում15 ուսումնասիրության ժամանակ Դաանի գենետիկական թեստի արդյունքները զգալիորեն տարբերվում էին (p <0,05)՝ համեմատած նրա տեղեկատու լաբորատոր թեստի հետ:Այս անհամապատասխանությունը կարող է պայմանավորված լինել SARS-CoV-2-ի հայտնաբերման հղման թեստի զգայունությամբ, և հետագա ուսումնասիրությունները կարող են կարևոր լինել պատճառը պարզելու համար:
Բացի այդ, մեր ուսումնասիրությունը գնահատեց SARS-CoV-2 BGI-ի համեմատական ​​կատարումը CRS-ի հետ՝ ցույց տալով գերազանց դրական տոկոսային համաձայնություն (PPA = 97.9%), բացասական տոկոսային համաձայնություն (NPA = 100%) և ընդհանուր տոկոսային համաձայնություն ըստ սեռի ( OPA): ). = 98,8%): Քոհենի Kappa արժեքները ցույց տվեցին լավ համաձայնություն (K = 0,975): Նիդեռլանդներում16 և Չինաստանում15 ուսումնասիրությունները ցույց են տվել հետևողական արդյունքներ: SARS-CoV-2 BGI թեստը մեկ գենի (ORF1a/b) հայտնաբերման թեստ է՝ օգտագործելով 10 մկլ ուժեղացման/հայտնաբերման լուծույթ: Չնայած մեր հղման արդյունքների հետ լավ վիճակագրական համաձայնությանը, վերլուծությունը բաց թողեց ընդհանուր ընտրանքի երկու դրական նմուշ (1.22%): Սա կարող է հսկայական կլինիկական հետևանքներ ունենալ փոխանցման դինամիկայի վրա ինչպես հիվանդի, այնպես էլ համայնքի մակարդակներում:
Մեկ այլ համեմատական ​​վերլուծություն, որն ընդգրկված է այս ուսումնասիրության մեջ, Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) վերլուծությունն էր. ընդհանուր համընկնման տոկոսը կազմել է 96,3%: Համաձայնության ուժը որոշվում էր նաև Քոհենի Կապպա արժեքով, որը կազմում էր 0,925, ինչը ցույց է տալիս CRS-ի հետ լիարժեք համաձայնությունը: Կրկին, մեր արդյունքները նույնական են Չինաստանի Չանշա քաղաքի Կենտրոնական Հարավային համալսարանում և Չինաստանի Լյուչժոու քաղաքի Լյուչժոու քաղաքի կլինիկական լաբորատորիայի կլինիկական լաբորատորիայի հետազոտություններին17: Չնայած վերը նշված լավ վիճակագրական համընկնումն արձանագրվել է, chi-square թեստը (MacNemar թեստ) ցույց է տվել, որ Sansure Biotech հետազոտության արդյունքը վիճակագրորեն նշանակալի տարբերություն է ունեցել CRS-ի համեմատ (p <0,005): Չնայած վերը նշված լավ վիճակագրական համընկնումն արձանագրվել է, chi-square թեստը (MacNemar թեստ) ցույց է տվել, որ Sansure Biotech հետազոտության արդյունքը վիճակագրորեն նշանակալի տարբերություն է ունեցել CRS-ի համեմատ (p <0,005): Несмотря на то, что было зафиксировано указанное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Манемара) показал, что результат վերլուծություն Sansure Biotech-ը նշում է статистически помое различный (критерий Манемара). Թեև վերը նշված լավ վիճակագրական համաձայնությունը գրանցվեց, chi-square թեստը (McNemar թեստ) ցույց տվեց, որ Sansure Biotech փորձարկման արդյունքը վիճակագրորեն նշանակալի տարբերություն ուներ CRS-ի համեմատ (p <0,005):尽管记录了上述良好的统计一致性，但卡方检验（MacNemar 检验）表明，Sansure Biotech 绌Sansure Biotech.相比具有统计学显着差异（p <0,005）։尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性 ， 但 检验 （（մակնեմար结果 与 crs 相比 具有 显着 (p <0,005………………………………………………. Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий Манемара) показал статистически значимую բազմազանություն (p < 0,005) վերլուծական Sansure Biotech և CRS: Չնայած վերը նշված լավ վիճակագրական համաձայնությանը, chi-square թեստը (McNemar թեստը) ցույց տվեց վիճակագրորեն նշանակալի տարբերություն (p <0,005) Sansure Biotech վերլուծության և CRS-ի միջև:Վեց նմուշ (3.66%) հայտնաբերվել է կեղծ բացասական՝ համեմատած CRS-ի հետ (Լրացուցիչ Աղյուսակ 1); սա շատ կարևոր է, հատկապես հաշվի առնելով վիրուսի փոխանցման դինամիկան: Վերոնշյալ տվյալները նույնպես աջակցում են այս ցածր հայտնաբերման արագությանը15:
Այս ուսումնասիրության մեջ Ct-ի արժեքները որոշվել են յուրաքանչյուր հետազոտության և համապատասխան հարթակի համար՝ ամենացածր միջին Ct արժեքով, որը հաղորդվել է Abbott SARS-CoV-2 վերլուծության մեջ: Այս արդյունքը կարող է կապված լինել Էբոթի միաժամանակյա համակցված գենետիկ թեստավորման համակարգի հետ՝ SARS-CoV-2-ի հայտնաբերման համար: Հետևաբար, համաձայն Գծապատկեր 1-ի, Abbott SARS-CoV-2-ի արդյունքների 87,6%-ի մոտ Ct արժեքներ են եղել 20-ից ցածր: Ընտրանքային արդյունքների միայն մի փոքր մասն է (12,4%) եղել 20-30 միջակայքում: 30-ից բարձր Ct արժեքները չեն գրանցվել: Ի լրումն Աբբոտի կողմից SARS-CoV-2 վահանակի գենետիկ թեստավորման ձևաչափի օգտագործման, այս արդյունքը կարող է կապված լինել հայտնաբերման ստորին սահմանի (32,5 ՌՆԹ պատճեն/մլ)18-ի հետ, որը երեք անգամ ցածր է ընկերության 100 ՌՆԹ-ի պատճենների ստորին սահմանից։ /մլ. մլ) 19.
Այս ուսումնասիրությունն ունի որոշ սահմանափակումներ. նախ՝ մենք չունենք ստանդարտ/հղումային մեթոդներ [օրինակ՝ վիրուսային ծանրաբեռնվածությունը կամ այլ լաբորատոր թեստեր (LDA)] ռեսուրսների սղության պատճառով: Երկրորդ, այս հետազոտության մեջ օգտագործված բոլոր նմուշները քթանցքային շվաբրեր էին, մինչդեռ արդյունքները կիրառելի չէին նմուշների այլ տեսակների համար, և երրորդը, մեր ընտրանքի չափը փոքր էր:
Այս ուսումնասիրությունը համեմատել է SARS-CoV-2-ի չորս rRT-PCR անալիզների կատարումը՝ օգտագործելով քթանցքային նմուշներ: Բոլոր հայտնաբերման փորձարկումներն ունեցել են գրեթե համադրելի արդյունավետություն, բացառությամբ Sansure Biotech վերլուծության: Բացի այդ, ցածր դրական գործակիցը հայտնաբերվել է Sansure Biotech վերլուծության մեջ՝ համեմատած CRS-ի հետ (p <0.05): Բացի այդ, ցածր դրական գործակիցը հայտնաբերվել է Sansure Biotech վերլուծության մեջ՝ համեմատած CRS-ի հետ (p <0.05): Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению со CRS (p < 0,05): Բացի այդ, Sansure Biotech թեստը ցույց տվեց դրական արդյունքների ցածր տոկոս՝ համեմատած CRS-ի հետ (p <0,05):此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05)»։此外，与CRS 相比，Sansure Biotech 检测的阳性率较低(p <0.05)»։ Кроме того, анализ Sansure Biotech-ի մալուխը ավելի ցածր է, քան результатов по сравнению со CRS (p < 0,05): Բացի այդ, Sansure Biotech վերլուծությունն ուներ ավելի ցածր դրական ցուցանիշ՝ համեմատած CRS-ի հետ (p <0.05):PPA-ի, NPA-ի և ընդհանուր համաձայնագրի Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) վերլուծությունը գերազանցել է 93,5%-ը՝ Cohen Kappa-ի համաձայնության արժեքի 0,925 հզորությամբ: Ի վերջո, Sansure Biotech Assay-ը (RUO) կարիք ունի լրացուցիչ վավերացման՝ Եթովպիայում օգտագործելու համար, և պետք է դիտարկել լրացուցիչ հետազոտություն՝ առանձին արտադրողների պահանջները գնահատելու համար:
Համեմատական ​​ուսումնասիրության նախագիծն իրականացվել է Ադիս Աբեբայի չորս առողջապահական հաստատություններում, Էկա Կոտեբե հիվանդանոցում, Հազարամյակի եկեղեցու բուժման կենտրոնում, Զևուդիտուի հիշատակի հիվանդանոցում և Սուրբ Պետրոսի տուբերկուլյոզի մասնագիտացված հիվանդանոցում: Տվյալները հավաքագրվել են 2020 թվականի դեկտեմբերի 1-ից 31-ն ընկած ժամանակահատվածում: Այս հետազոտության համար նախատեսված բժշկական հաստատությունները նպատակաուղղված են ընտրվել՝ ելնելով դրանց մեծ թվից և քաղաքում բուժման հիմնական կենտրոնների առկայությունից: Նմանապես, գործիքները, ներառյալ ABI 7500 և Abbott m2000 իրական ժամանակի PCR գործիքները, ընտրվել են NAAT ռեագենտների արտադրողների առաջարկությունների համաձայն, և այս հետազոտության համար ընտրվել են չորս PCR հայտնաբերման հավաքածուներ, քանի որ Եթովպիայի լաբորատորիաների մեծ մասը օգտագործել է առնվազն առնվազն: նրանցից չորսը. Գենի թեստը, Abbott SARS-CoV-2 թեստը, Sansure Biotech թեստը և SARS-CoV-2 BGI թեստը կատարված ուսումնասիրության ընթացքում):
SARS-CoV-2-ի թեստավորումն իրականացվել է 2020 թվականի դեկտեմբերի 1-ից մինչև 30-ը, օգտագործելով 3 մլ վիրուսային տրանսպորտային միջոց (VTM) (Miraclean Technology, Շենժեն, Չինաստան) այն անձանցից, ովքեր հետաքննվում են COVID-19-ի համար՝ հղում կատարելով EPHI-ին: Նազոֆարինգի նմուշները հավաքվել են վերապատրաստված նմուշ հավաքողների կողմից և ուղարկվել EPHI եռակի փաթեթներով: Նախքան նուկլեինաթթվի մեկուսացումը, յուրաքանչյուր նմուշին տրվում է եզակի նույնականացման համար: Յուրաքանչյուր նմուշից արդյունահանումը կատարվում է անմիջապես ժամանելուն պես՝ օգտագործելով ձեռքով և ավտոմատ արդյունահանման մեթոդները: Այսպիսով, Abbott m2000-ի ավտոմատ արդյունահանման համար յուրաքանչյուր նմուշից 1,3 մլ (ներառյալ 0,8 մլ մեռած ծավալը և 0,5 մլ արդյունահանման մուտքային ծավալը) արդյունահանվել է և անցել Abbott ԴՆԹ-ի նմուշների պատրաստման համակարգով (Abbott Molecular Inc. des Plaines, ԻԼ, ԱՄՆ): ) 96 [92 նմուշ, երկու հայտնաբերման հսկիչ և երկու ոչ կաղապարային հսկիչ (NTC)] խմբաքանակ ներառվել է իրական ժամանակում SARS-CoV-2-ի (EUA) երկու փուլերի ընդհանուր գործընթացում (առբերում և հայտնաբերում): հանքարդյունաբերություն. Նմանապես, ձեռքով արդյունահանման համար օգտագործեք նույն նմուշները (ավտոմատ արդյունահանման և հայտնաբերման համար): Այսպիսով, ողջ գործընթացի ընթացքում 140 մկլ նմուշներ վերցվել և արդյունահանվել են QIAamp վիրուսային RNA Mini Kit-ի միջոցով (QIAGEN GmbH, Hilden, Գերմանիա) 24 խմբաքանակով (ներառյալ 20 նմուշ, երկու փորձարկման հսկիչ և երկու NTCs) ինը փուլերի ընթացքում: Ձեռքով արդյունահանված էլուատները ուժեղացվել և հայտնաբերվել են ABI 7500 ջերմային ցիկլերի միջոցով՝ SARS-CoV-2 BGI, Daan Gene և Sansure Biotech վերլուծության միջոցով:
SARS-CoV-2 վիրուսային ՌՆԹ-ի ավտոմատ մեկուսացումը և մաքրումը հետևում է մագնիսական բշտիկի սկզբունքին, օգտագործելով Abbott ԴՆԹ-ի նմուշների պատրաստման ռեագենտները: Նմուշների ապաակտիվացումը և վիրուսային մասնիկների լուծարումն իրականացվում է գուանիդին իզոթիոցիանատ պարունակող լվացող միջոցի միջոցով՝ սպիտակուցը դենատուրացնելու և RNase-ն ապաակտիվացնելու համար: Այնուհետև ՌՆԹ-ն առանձնացվում է սպիտակուցից՝ պինդ ֆազային տարանջատման միջոցով՝ օգտագործելով սիլիցիում, այսինքն՝ գուանիդինի աղը և լիզի բուֆերի ալկալային pH-ը նպաստում են նուկլեինաթթուների միացմանը սիլիցիումի հետ (SiO2): Ողողման քայլը հեռացնում է մնացած սպիտակուցներն ու մնացորդները՝ պարզ լուծում ստանալու համար: Թափանցիկ ՌՆԹ-ն մեկուսացված է սիլիցիումի վրա հիմնված միկրոմասնիկներից՝ օգտագործելով գործիքի մագնիսական դաշտը20,21: Մյուս կողմից, ՌՆԹ-ի ձեռքով մեկուսացումն ու մաքրումն իրականացվում է պտտվող սյունակի մեթոդով, օգտագործելով ցենտրիֆուգացիա՝ մագնիսական հենարանի փոխարեն և միկրոմասնիկների տարանջատում էլուենտից:
Abbott Real-Time SARS-CoV-2-ի հայտնաբերման թեստը (Abbott Molecular, Inc.) կատարվել է արտադրողի ցուցումների համաձայն, որը ստացել է EUA19,22 ԱՀԿ-ից և FDA-ից: Այս արձանագրության մեջ նմուշի ապաակտիվացումը նախքան արդյունահանումը կատարվել է ջրային բաղնիքում 56 °C ջերմաստիճանում 30 րոպե: Վիրուսի ապաակտիվացումից հետո նուկլեինաթթվի արդյունահանումն իրականացվել է Abbott m2000 SP գործիքի վրա 0,5 մլ VTM-ից՝ օգտագործելով Abbott m2000 ԴՆԹ նմուշի պատրաստման համակարգ: ըստ արտադրողի. Ուժեղացումն ու հայտնաբերումը կատարվել են Abbott m2000 RT-PCR գործիքի միջոցով, իսկ RdRp և N գեների կրկնակի հայտնաբերումը: ROX) և VIC P (հատուկ ներկ) ներքին հսկողության թիրախավորման և հայտնաբերման համար, ինչը թույլ է տալիս միաժամանակ հայտնաբերել ուժեղացման երկու արտադրանքները 19:
Այս հավաքածուի ուժեղացման հայտնաբերման մեթոդը հիմնված է մեկ քայլով RT-PCR տեխնոլոգիայի վրա: ORF1a/b և N գեները ընտրվել են որպես պահպանված շրջաններ Daan Gene Technology-ի կողմից՝ թիրախային շրջանի ուժեղացումը հայտնաբերելու համար: Հատուկ պրայմերներ և լյումինեսցենտային զոնդեր (N գենային զոնդերը պիտակավորված FAM-ով, ORF1a/b զոնդերը պիտակավորված VIC-ով) նախագծվել են SARS-CoV-2 ՌՆԹ-ն նմուշներում հայտնաբերելու համար: Վերջնական էլյուենտը և հիմնական խառնուրդները պատրաստվել են՝ ավելացնելով 5 մկլ էլյուենտ հիմնական խառնուրդի 20 մկլ-ին մինչև 25 մկլ վերջնական ծավալը: Ուժեղացումն ու հայտնաբերումը կատարվել են միաժամանակ ABI 750024 իրական ժամանակի PCR գործիքի վրա:
ORF1a/b և N գեները հայտնաբերվել են Sansure Biotech nCoV-2019 Nucleic Acid Diagnostic Kit-ի միջոցով (ֆլուորեսցենտային PCR հայտնաբերում): Պատրաստեք հատուկ զոնդեր յուրաքանչյուր թիրախային գենի համար՝ ընտրելով FAM ալիքը ORF1a/b տարածաշրջանի համար և ROX ալիքը՝ N գենի համար: Այս վերլուծության հավաքածուին, էլուենտ և հիմնական խառնուրդի ռեակտիվները ավելացվում են հետևյալ կերպ. հայտնաբերման/ուժեղացման համար պատրաստեք 30 մկլ հիմնական խառնուրդի ռեակտիվ և 20 մկլ զտված նմուշ: Իրական ժամանակի PCR ABI 750025-ն օգտագործվել է ուժեղացման/հայտնաբերման համար:
SARS-CoV-2 BGI թեստը լյումինեսցենտ իրական ժամանակի rRT-PCR հավաքածու է COVID-19-ի ախտորոշման համար: Թիրախային շրջանը գտնվում է SARS-CoV-2 գենոմի ORF1a/b տարածաշրջանում, որը մեկ գենի հայտնաբերման մեթոդ է։ Բացի այդ, մարդու տնային տնտեսության β-ակտին գենը ներքին կարգավորվող թիրախային գեն է: Հիմնական խառնուրդը պատրաստվում է՝ խառնելով 20 մկլ հիմնական խառնուրդի ռեագենտը և 10 մկլ արդյունահանված ՌՆԹ-ի նմուշը ջրհորի ափսեում26: ABI 7500 ֆլուորեսցենտային քանակական իրական ժամանակի PCR գործիքն օգտագործվել է ուժեղացման և հայտնաբերման համար: Նուկլեինաթթվի բոլոր ուժեղացումը, PCR-ի գործարկման պայմանները յուրաքանչյուր հետազոտության համար և արդյունքների մեկնաբանումը կատարվել են համապատասխան արտադրողի ցուցումների համաձայն (Աղյուսակ 3):
Այս համեմատական ​​վերլուծության մեջ մենք չօգտագործեցինք հղման ստանդարտ մեթոդ՝ չորս վերլուծությունների համար տոկոսային համաձայնության (դրական, բացասական և ընդհանուր) և այլ համեմատական ​​պարամետրեր որոշելու համար: Յուրաքանչյուր թեստի համեմատություն արվել է CRS-ի հետ, այս ուսումնասիրության մեջ CRS-ը սահմանվել է «ցանկացած դրական» կանոնով և արդյունքը որոշվել է, ոչ թե մեկ թեստով, մենք օգտագործել ենք առնվազն երկու համընկնող թեստի արդյունք: Բացի այդ, COVID-19-ի փոխանցման դեպքում կեղծ բացասական արդյունքներն ավելի վտանգավոր են, քան կեղծ դրական արդյունքները։ Հետևաբար, CRS-ի արդյունքից հնարավորինս «դրական» ասելու համար առնվազն երկու վերլուծության թեստը պետք է դրական լինի, ինչը նշանակում է, որ առնվազն մեկ դրական արդյունք հավանաբար կգա EUA-ի վերլուծությունից: Այսպիսով, չորս թեստի արդյունքներից երկու կամ ավելի թեստի արդյունքներ, որոնք տալիս են նույն արդյունքը, համարվում են իրական դրական կամ բացասական18,27:
Տվյալները հավաքագրվել են կառուցվածքային տվյալների արդյունահանման ձևերի միջոցով, տվյալների մուտքագրումը և վերլուծությունը կատարվել են Excel վիճակագրական ծրագրաշարի և SPSS 23.0 տարբերակի միջոցով՝ նկարագրական վիճակագրության համար: Դրական, բացասական և ընդհանուր տոկոսային համաձայնությունը վերլուծվել է, և Kappa միավորը օգտագործվել է CRS-ի հետ յուրաքանչյուր մեթոդի համաձայնության աստիճանը որոշելու համար: Kappa արժեքները մեկնաբանվում են հետևյալ կերպ՝ 0,01-ից 0,20 մեղմ համաձայնության համար, 0,21-ից 0,40՝ ընդհանուր համաձայնության համար, 0,41-0,60՝ չափավոր համաձայնության համար, 0,61-0,80՝ հիմնական համաձայնության և 0,81-0,99՝ ամբողջական համաձայնության համար28:
Էթիկական թույլտվությունը ստացվել է Ադիս Աբեբայի համալսարանից և այս հետազոտության բոլոր փորձարարական արձանագրությունները հաստատվել են Եթովպիայի հանրային առողջության ինստիտուտի Գիտական ​​էթիկայի վերանայման խորհրդի կողմից: EPHI էթիկայի լիցենզիայի տեղեկանքի համարը EPHI/IRB-279-2020 է: Բոլոր մեթոդները կիրառվել են Եթովպիայի ազգային համապարփակ ուղեցույցների՝ COVID-19-ի բուժման առաջարկություններին և դրույթներին համապատասխան: Բացի այդ, հետազոտության բոլոր մասնակիցներից ստացվել է գրավոր տեղեկացված համաձայնություն՝ նախքան հետազոտությանը մասնակցելը:
Այս ուսումնասիրության ընթացքում ձեռք բերված կամ վերլուծված բոլոր տվյալները ներառված են այս հրապարակված հոդվածում: Այս ուսումնասիրության արդյունքներին աջակցող տվյալները հասանելի են համապատասխան հեղինակի կողմից ողջամիտ պահանջով:
Առողջապահության համաշխարհային կազմակերպություն։ Առաջարկություններ COVID-19-ի համար լաբորատոր փորձարկման ռազմավարությունների համար. միջանկյալ ուղեցույց, 2020 թվականի մարտի 21 թիվ WHO/2019-nCoV/lab_testing/2020.1 (ԱՀԿ, 2020):
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 խելացի ախտորոշում Արտակարգ իրավիճակների բաժանմունքում. All-in-ը գործնականում: Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 խելացի ախտորոշում Արտակարգ իրավիճակների բաժանմունքում. All-in-ը գործնականում:Muliou, DS, Pantazopoulos, I. and Gurgulianis, KI COVID-19-ի խելացի ախտորոշում շտապ օգնության բաժանմունքում. ամեն ինչ գործնականում:Muliou DS, Pantazopoulos I. and Gurgulyanis KI COVID-19-ի խելացի ախտորոշում արտակարգ իրավիճակների բաժանմունքներում. ծայրից ծայր ինտեգրում գործնականում: Փորձագետ վերապատվելի շնչառություն. դեղ։ 3, 263–272 (2022).
Mitchell, SL & St George, K. COVID19 ID NOW EUA-ի գնահատում: Mitchell, SL & St George, K. COVID19 ID NOW EUA-ի գնահատում:Mitchell, SL and St. George, K. Evaluation of the COVID19 ID NOW EUA assay:Mitchell SL և St. George K. COVID19 ID NOW EUA-ի գնահատում: J. Կլինիկական. Վիրուս։ 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020 թ.):
ԱՀԿ։ Կորոնավիրուսային հիվանդության լաբորատոր հայտնաբերում 2019 (COVID-19) մարդկանց մոտ կասկածվող հիվանդության դեպքում. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (մուտք՝ 2020 թվականի օգոստոսի 15) (ԱՀԿ, 2020):
Udugama, B. et al. COVID-19 ախտորոշում. հիվանդություններ և փորձարկման գործիքներ. ACS Nano 14 (4), 3822–3835 (2020):
Syed S. et al. Արևելյան, Կենտրոնական և Հարավային Աֆրիկայի ախտաբանների քոլեջի ստեղծում՝ Մերձավոր Արևելքի և Հարավային Աֆրիկայի պաթոլոգիայի տարածաշրջանային դպրոց: Աֆրիկա. J. Lab. դեղ։ 9 (1), 1-8 (2020):
Եթովպիայի հանրային առողջության ինստիտուտ, Առողջապահության դաշնային նախարարություն: COVID-19-ի լաբորատոր ախտորոշման միջանկյալ ազգային ռազմավարություն և ուղեցույց. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI_PHEOC_COVID-19_Laboratory_Diagnosis_Eng.pdf (մուտք՝ 2020 թվականի օգոստոսի 12-ին) (EPHI, 2020):
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Կեղծ բացասական թեստեր SARS-CoV-2 վարակի մարտահրավերների և հետևանքների համար: Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Կեղծ բացասական թեստեր SARS-CoV-2 վարակի մարտահրավերների և հետևանքների համար:Voloshin S., Patel N. և Kesselheim AS կեղծ բացասական թեստեր SARS-CoV-2 վարակների և դրանց հետևանքների համար:Voloshin S., Patel N. և Kesselheim AS կեղծ բացասական թեստեր սադրանքի և SARS-CoV-2 վարակի ազդեցության համար: N. eng. J. Բժշկություն. 383(6), e38 (2020):
Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Կեղծ դրական և կեղծ բացասական COVID-19 դեպքեր. Շնչառության կանխարգելման և կառավարման ռազմավարություններ, պատվաստումներ և հետագա հեռանկարներ: Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Կեղծ դրական և կեղծ բացասական COVID-19 դեպքեր. Շնչառության կանխարգելման և կառավարման ռազմավարություններ, պատվաստումներ և հետագա հեռանկարներ: Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Ложноположительные и ложноотрицательные դեպք COVID-19. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI COVID-19-ի կեղծ դրական և կեղծ բացասական դեպքեր. շնչառական կանխարգելման և բուժման ռազմավարություններ, պատվաստումներ և առաջընթացի ուղի:Muliu, DS and Gurgulianis, KI COVID-19-ի կեղծ դրական և կեղծ բացասական դեպքեր. շնչառական կանխարգելման և բուժման ռազմավարություններ, պատվաստումներ և հետագա ուղի: Փորձագետ վերապատվելի շնչառություն. դեղ։ 15(8), 993–1002 (2021):
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. COVID-19 ախտորոշում շտապ օգնության բաժանմունքում. Տեսնելով ծառը, բայց կորցնում է անտառը: Mouliou, DS, Ioannis, P. & Konstantinos, G. COVID-19 ախտորոշում շտապ օգնության բաժանմունքում. Տեսնելով ծառը, բայց կորցնում է անտառը:Mouliou, DS, Ioannis, P. and Konstantinos, G. COVID-19 Ախտորոշում Արտակարգ իրավիճակների բաժնում. Տեսեք ծառը, կորցրեք անտառը:Muliou DS, Ioannis P. և Konstantinos G. COVID-19 Ախտորոշում շտապօգնության սենյակներում. ծառերի համար բավարար անտառ չկա: Հայտնվել. դեղ։ J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022):
Degli-Angeli, E. et al. Abbott RealTime SARS-CoV-2 հետազոտության վերլուծական և կլինիկական կատարողականի վավերացում և վավերացում: J. Կլինիկական. Վիրուս։ 129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020 թ.):
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Համեմատեք հինգ պրայմերների հավաքածուներ COVID-19-ի տարբեր գենոմային շրջանից՝ սովորական RT-PCR-ով վիրուսային վարակի հայտնաբերման համար: Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. Covid-19-ի տարբեր գենոմային շրջաններից հինգ պրայմերների հավաքածուների համեմատություն՝ վիրուսային վարակի հայտնաբերման համար սովորական RT-PCR-ով:Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. and Aflatunyan, B. Covid-19 գենոմի տարբեր շրջաններից պրայմերների հինգ հավաքածուների համեմատություն՝ վիրուսային վարակի հայտնաբերման համար սովորական RT-PCR-ով: Մոլլաեյ, Հ.Ռ., Աֆշար, Ա.Ա., Քալանթար-Նեյստանակի, Դ., Ֆազլալիպուր, Մ. & Աֆլաթունյան, Բ. 比较来自COVID-19不同基因组区域的五个引物组，用于通过常规RT-PCR 检测病毒感染。 Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. COVID-19-ի 5 տարբեր գենետիկական շրջանների համեմատություն՝ սովորական RT-PCR-ով վիրուսային վարակի հայտնաբերման համար:Mollaei HR, Afshar AA, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. and Aflatunyan B. Covid-19 գենոմի տարբեր շրջաններից պրայմերների հինգ հավաքածուների համեմատություն՝ վիրուսային վարակի հայտնաբերման համար սովորական RT-PCR-ով:Իրան. J. Մանրէաբանություն. 12 (3), 185 (2020):
Goertzer, I. et al. SARS-CoV-2 գենոմի հաջորդականությունների հայտնաբերման որակի ազգային արտաքին գնահատման ծրագրի նախնական արդյունքները. J. Կլինիկական. Վիրուս։ 129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020 թ.):
Wang, M. et al. Կորոնավիրուսի ծանր սուր շնչառական համախտանիշի համար հինգ RT-PCR փաթեթների արդյունավետության վերլուծական գնահատում 2. J. Clinical. լաբորատորիա։ անուս. 35(1), e23643 (2021):
Wang B. et al. Չինաստանում առևտրային հասանելի յոթ SARS-CoV-2 ՌՆԹ հայտնաբերման փաթեթների գնահատում իրական ժամանակի պոլիմերազային շղթայական ռեակցիայի (PCR) հիման վրա: կլինիկական. Քիմիական. լաբորատորիա։ դեղ։ 58(9), e149–e153 (2020):
վան Կաստերեն, ՊԲ և այլք: Յոթ առևտրային RT-PCR COVID-19 ախտորոշիչ փաթեթների համեմատություն: J. Կլինիկական. Վիրուս։ 128, 104412 (2020):
Լու, Յու և այլք: SARS-CoV-2 նուկլեինաթթուների հայտնաբերման համար երկու PCR փաթեթների ախտորոշիչ կատարողականի համեմատություն. J. Կլինիկական. լաբորատորիա։ անուս. 34(10), e23554 (2020):
Lefart, PR և այլն: SARS-CoV-2 նուկլեինաթթվի ուժեղացման փորձարկման (NAAT) չորս հարթակների համեմատական ​​ուսումնասիրությունը ցույց տվեց, որ ID NOW-ի կատարումը զգալիորեն վատթարացել է՝ կախված հիվանդի և նմուշի տեսակից: ախտորոշում. մանրէաբանություն. Վարակել. դիսս. 99(1), 115200 (2021):
Էբոթի մոլեկուլ. Abbott իրական ժամանակում SARS-CoV-2 վերլուծության փաթեթի ներդիր: https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay: 1-12. (2020 թվականի օգոստոսի 10-ի դրությամբ) (2020 թ.):
Klein, S. et al. SARS-CoV-2 ՌՆԹ-ի մեկուսացում մագնիսական ուլունքների միջոցով՝ RT-qPCR-ի և RT-LAMP-ի միջոցով արագ լայնածավալ հայտնաբերման համար: Վիրուս 12(8), 863 (2020):